沼气工程设备制作的沼肥比较适合进行基肥深施，在水田里施肥的时候醉好是在耕田的时候进行，这样一来就会让泥和肥进行充分的结合，如果想要在旱田里面进行施用的话就要集中起来进行施用，然后在上面盖上100毫米的土，这样一来就能够减少养分的挥发；做追肥使用的话要按照沼肥的质量和作物的生长情况来进行掺水处理，以免伤害到作物的幼根和嫩叶。

       沼气工程设备产出的沼渣、沼液本身就是天然的有机肥料，不光是可以作为基肥和追肥使用，还可以作为养鱼的饲料来使用；而且这样一来的话会大大的减少环境污染的情况，从而实现种植业、养殖业的一个和谐发展。而且这样不仅是解决了养殖污染所带来的环境污染的问题，还可以把废弃物进行资源化利用，从而带来客观的效益。