1.沼气会产生硫化氢，硫化氢具有较强的毒性，空气中浓度为14.mg/m3（标）时，会引起结膜发炎和角膜发炎，当浓度大约为280mg/m3（标）时会造成昏迷，呼吸困难乃至死亡。

    2.硫化氢燃烧生成的二氧化硫，遇水生成硫酸分子，腐蚀周围的设备，污染环境，接触到金属，格外是有色金属就会发生腐蚀。

    3.脱硫方法 现行的沼气脱硫方式按照理化性质，大致可以分别采用物理、化学和生物三种方法。而沼气脱硫设备直接脱硫方法按照原理的不同又可分为湿式法和干式法。